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L'imagerie multi-modale, vers une nouvelle ère de l'imagerie pour comprendre le vivant (séminaire organisé conjointement avec l'Institut de Biologie Computationelle)

Jean-Luc Verdeil
CIRAD, UMR AGAP
le 05/04/2013 à 11:00

Résumé

Devant l’abondance croissante des données issues des approches "omiques" et face à face à la complexité des processus se déroulant dans un organisme vivant il est indispensable de développer des nouvelles méthodes qui permettront de replacer les données analytiques dans le contexte de la physiologie de l’organe vivant. Qu’elle soit multiple, corrélative ou multimodale, l’imagerie entre dans l’ère de la combinatoire ce qui doit permettre de répondre à ce nouvel enjeu de la biologie. Il s’agit d’appliquer différentes méthodes d’imagerie (IRM, tomographie RX, imagerie de fluorescence, microscopie électronique) à un même échantillon de façon à générer des images porteuses d’informations complémentaires sur la structure, la biochimie et la fonction de l’organe. La fusion des images issues des différentes sources permet de générer une image composite porteuse d’une grande diversité d’informations complémentaires permettant d’analyser les relations structure-fonction sous un nouveau regard. Dans cette présentation, nous ferons le point sur l’état d’avancement de l’imagerie combinatoire. Nous analyseront comment les avancées méthodologiques qui combinent vieilles recettes et nouvelles techniques de préparation des échantillons, techniques d’imagerie, traitement des images et visualisation ont conduit à l’avènement de l’imagerie multimodale. Nous illustrerons à partir d’exemples empruntés à la biologie animale et à la biologie végétale la plus-value apportée par l’image composite issue de la combinaison de différentes sources d’imagerie. Nous discuterons son potentiel comme substrat pour la modélisation des phénomènes biologiques.